内容简介
《微生物基因组》是由微生物基因组学开创者们撰写,重点介绍了10年来微生物学转向全基因组序列研究的进展,包括微生物基因组学的历史、作为基因组学工具的生物信息学、核心功能、微生物基因组的进化、微生物基因组的调查和基因组数据库的应用共6个部分。所有内容均涉及本学科前沿,作者们现身说法,深入浅出,既能使初涉微生物基因组学领域的研究生们感兴趣,又能使在微生物学和基因组学方面有造诣的专家们参考,是微生物学专著中的精品。
目 录
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译者的话
序
前言
编著者
**部分:引言
1 微生物基因组学的历史 Hamilton O. Smith(3)
第二部分:作为基因组学工具的生物信息学
2 寻找基因和全基因组比较的工具 Steven L. Salzberg and Arthur L. Delcher(19)
3 TIGR 的细菌基因组注释 Owen White(31)
4 生物信息学与微生物致病作用 Fiona S. L .Brinkman and Joanna L. Fueyo(43)
5 噬菌体生物信息学 Derrick E. Fouts(62)
第三部分:核心功能
6 微生物代谢比较 Karen E. Nelson(83)
7 膜转运蛋白的基因组学分析 Ian T .Paulsen ,Katherine H .Kang ,Mark E .Hance ,and Qinghu Ren(97)
8 用基因组学分析细菌细胞周期 Michael T. Laub ,Harley H .McAdams and Lucy Shapiro(110)
第四部分:微生物基因组的进化
9 原核生物的进化及分类简史 Lorraine Olendzenski ,Olga Zhaxybayeva and J. Peter Gogarten(125)
10 细菌基因组如何变化 Timothy D .Read and Garry S. A. Myers(137)
11 基因组学时代的细菌生物多样性概念 Frederick M .Cohan(153)
12 病原菌和共生菌与寄主的协同进化 Robert A. Feldman(170)
第五部分:微生物基因组的调查
13 植物病原菌基因组调查 C .Robin Buell(185)
14 不产氧光合细菌 F .Robert Tabita and Thomas E .Hanson(194)
15 嗜热微生物基因组 Frank T .Robb(212)
16 病原肠细菌基因组 Julian Parkhill and Nicholas R. Thomson(231)
17 专性细胞内病原体 Siv G .E .Andersson(251)
18 低G + C含量革兰氏阳性细菌基因组 Steven R .Gill(266)
19 放线菌(G+ ,高G + C 含量)基因组学 Stephen D .Bentley , Roland Brosch , Stephen V. Gordon , David A. Hopwood ,and Stewart T. Cole(289)
20 寄生虫基因组学 Malcolm J .Gardner(312)
21 **嗜盐古生菌基因组分析Shiladitya DasSarma(331)
第六部分:基因组数据库的应用
22 微阵列表达分析和细菌基因组 Carsten Rosenow and Brian Tjaden(349)
23 微生物种群基因组学与生态学 Edward F .DeLong(362)
24 基因组学在生物催化和生物降解中的应用 Lawrence P .Wackett(382)
25 酶的发现与微生物基因组学 Robert M Kelly and Keith R Shockley(397)
26 基因组学在药物发现过程中的整合 Jacques Ravel(417)
27 基因组法开发疫苗 Rino Rappuoli , Vega Masignani , Mariagrazia Pizza , Guido Grandi and John L. Telford(434)
28 微生物蛋白质组学 Svend Birkelund , Brian B. Vandahl , Allan C. Shaw and Gunna Christiansen(443)
索引 (457)
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